Bentos
Este grupo de trabajo explora la diversidad de macroinvertebrados que habitan en el sedimento y en las macrófitas de los ecosistemas acuáticos continentales, así como las respuestas ecofisiológicas de los mismos frente a los disturbios antropogénicos.
Plancton y Biofilms
En este laboratorio se analiza la estructura y función de las microcomunidades que habitan la columna de agua (plancton) y de las que revisten distintos tipos de sustratos (biofilms), que se hallan en los cuerpos de agua continentales.
Ecología de peces
Este grupo de trabajo se dedica a estudiar los ensambles de peces de ambientes acuáticos continentales y su relación con las características del ecosistema y su entorno social.
Ecología de insectos
En este laboratorio se analizan aspectos relacionados con la biodiversidad de Diptera, Culicidae. Estudio de las comunidades de insectos que habitan en fitotelmata (cavidades de plantas que acumulan agua, como por ej. axilas de hojas, huecos en troncos, etc.).
Ciclos biogeoquímicos
Este grupo de trabajo se dedica a determinar el efecto de las aplicaciones de pesticidas en los cultivos sobre la fauna de los arroyos adyacentes...
Cuenca del Salado
Los integrantes del área están abocados al estudio de limnología aplicada del río Salado y lagunas de su cuenca.
Entomología
Las tareas de este grupo de trabajo están abocadas al estudio de la biodiversidad de la entomofauna acuática de la Argentina, en especial en lo referido al grupo Culicomorpha (Diptera).
Herpetología
En este grupo se llevan adelante diversas líneas de investigación, siendo algunas particulares de ciertos/as integrantes/as y otras transversales a todos/as ellos/as. Se llevan adelante dos tipos de tareas fundamentales que tienen a la herpetofauna como objetivo..