Este grupo de trabajo explora la diversidad de macroinvertebrados que habitan en el sedimento y en las macrófitas de los ecosistemas acuáticos continentales, así como las respuestas ecofisiológicas de los mismos frente a los disturbios antropogénicos. Su principal área de interés actual son los ríos, arroyos y bañados de desborde fluvial pampeanos y el estuario del Río de la Plata. Mediante la información generada a partir de sus estudios se pretende realizar una caracterización ecológica de estos ambientes a partir del desarrollo y aplicación de índices bióticos de polución y de diversidad. además de rasgos biológicos. De esta manera se generan herramientas de aplicación que son destinadas al diagnóstico,  evaluación y la gestión de los sistemas lóticos pampásicos, en general puestas a disposición de las autoridades de aplicación. Como parte de las tareas de este grupo también se encuentra la identificación de biomarcadores bioquímicos, fisiológicos en invertebrados acuáticos, para la evaluación de ecosistemas lóticos pampeanos expuestos a pesticidas y otras sustancias exógenas, el estudio de la plasticidad reproductiva de invertebrados acuáticos integrantes del bentos y el análisis e interpretación de las relaciones tróficas y la estequiometría ecológica en macroinvertebrados. Una  línea de investigación del grupo está vinculado a la rehabilitación de ambientes lóticos a partir  del trasplante de macrófitas nativas de forma experimental. Para cumplir con los objetivos de trabajo el equipo realiza investigaciones de ciencia básica y aplicada tanto de campo como de laboratorio.